益智模式
益智模式（Puzzle Mode，民間又譯解謎模式）是植物大戰殭屍的遊戲模式之一，包含兩個（手機版則為三個）不同的益智關卡類型。該模式通過冒險模式的4-6中隨機一個殭屍掉落的禮物盒而解鎖，但玩家在通關冒險模式前無法遊玩全部的益智模式關卡。而在手機版中，玩家只能遊玩每個類型的第一關，必須購買花瓶終結者、殭屍公敵與堅不可摧的遊戲包才能完整遊玩，其中花瓶終結者與殭屍公敵需要$150000，堅不可摧需要$100000。
花瓶終結者
主條目：花瓶終結者
在花瓶終結者（Vasebreaker）系列關卡中，玩家需要用錘子敲碎（點擊）在草坪上存在的花瓶，花瓶里可能會有植物、殭屍或陽光。為了通關，要打碎所有花瓶並消滅所有殭屍。不同關卡有不同的植物和殭屍，但這些關卡有部分共性：大部分關卡都有面向左邊的雙重射手，以及在一路向左之後，所有關卡都有兩個必出植物的，有着葉子圖案的綠色花瓶，而大部分花瓶是帶有問號的棕色花瓶，無法確認內容。花瓶里出現的陽光可以用於種植櫻桃炸彈以緩解壓力。路燈花可以照透其周圍的花瓶，顯現其內容。在破壞之王與花瓶終結者（無限）中，總會出現一個巨人殭屍，並且在「花瓶終結者（無限）」中每過10波會多一個巨人殭屍（最多為9個）。
殭屍公敵
主條目：殭屍公敵
在殭屍公敵（I， Zombie）系列關卡中，玩家不再要種植植物消滅殭屍，而是放置殭屍擊敗紙板做的植物，吃到草坪末尾的腦子，吃完5條路的腦子才能過關（或在殭屍公敵（無限）中，進入下一波）。如果腦子沒吃完、草坪上沒有殭屍、並且陽光數小於25時，關卡失敗。紙板植物與普通的植物行為一致，除了向日葵不會產陽光，被吃掉會獲得200陽光（或者說，殭屍每吃一口掉25陽光）。
堅不可摧
主條目：堅不可摧（益智模式）
在手機版獨占的堅不可摧（Last Stand）系列關卡中，玩家的陽光預算被限制了（在白天與黑夜為3000陽光，泳池與濃霧為4000陽光，屋頂與無盡為5000陽光）。與同名迷你遊戲的區別是，在準備階段，可以賣掉植物歸還陽光（但出現損傷點的植物不會歸還陽光，包括南瓜頭、大蒜、堅果、高堅果、鋼地刺；並且紫卡植物只會歸還紫卡本身的陽光，例如玩家賣掉冰西瓜，只會歸還冰西瓜的200陽光，不會歸還西瓜投手的300陽光）。除無盡關卡外，玩家只能用預先選好的植物。