益智模式
益智模式（Puzzle Mode，民间又译解谜模式）是植物大战僵尸的游戏模式之一，包含两个（手机版则为三个）不同的益智关卡类型。该模式通过冒险模式的4-6中随机一个僵尸掉落的礼物盒而解锁，但玩家在通关冒险模式前无法游玩全部的益智模式关卡。而在手机版中，玩家只能游玩每个类型的第一关，必须购买花瓶终结者、僵尸公敌与坚不可摧的游戏包才能完整游玩，其中花瓶终结者与僵尸公敌需要$150000，坚不可摧需要$100000。
花瓶终结者
主条目：花瓶终结者
在花瓶终结者（Vasebreaker）系列关卡中，玩家需要用锤子敲碎（点击）在草坪上存在的花瓶，花瓶里可能会有植物、僵尸或阳光。为了通关，要打碎所有花瓶并消灭所有僵尸。不同关卡有不同的植物和僵尸，但这些关卡有部分共性：大部分关卡都有面向左边的双重射手，以及在一路向左之后，所有关卡都有两个必出植物的，有着叶子图案的绿色花瓶，而大部分花瓶是带有问号的棕色花瓶，无法确认内容。花瓶里出现的阳光可以用于种植樱桃炸弹以缓解压力。路灯花可以照透其周围的花瓶，显现其内容。在破坏之王与花瓶终结者（无限）中，总会出现一个巨人僵尸，并且在“花瓶终结者（无限）”中每过10波会多一个巨人僵尸（最多为9个）。
僵尸公敌
主条目：僵尸公敌
在僵尸公敌（I， Zombie）系列关卡中，玩家不再要种植植物消灭僵尸，而是放置僵尸击败纸板做的植物，吃到草坪末尾的脑子，吃完5条路的脑子才能过关（或在僵尸公敌（无限）中，进入下一波）。如果脑子没吃完、草坪上没有僵尸、并且阳光数小于25时，关卡失败。纸板植物与普通的植物行为一致，除了向日葵不会产阳光，被吃掉会获得200阳光（或者说，僵尸每吃一口掉25阳光）。
坚不可摧
主条目：坚不可摧（益智模式）
在手机版独占的坚不可摧（Last Stand）系列关卡中，玩家的阳光预算被限制了（在白天与黑夜为3000阳光，泳池与浓雾为4000阳光，屋顶与无尽为5000阳光）。与同名迷你游戏的区别是，在准备阶段，可以卖掉植物归还阳光（但出现损伤点的植物不会归还阳光，包括南瓜头、大蒜、坚果、高坚果、钢地刺；并且紫卡植物只会归还紫卡本身的阳光，例如玩家卖掉冰西瓜，只会归还冰西瓜的200阳光，不会归还西瓜投手的300阳光）。除无尽关卡外，玩家只能用预先选好的植物。